Bilkom został udostępniony jako aplikacja na telefony i serwis mobilny m.bilkom.pl. Wcześniej należy zarejestrować się na stronie bilkom.pl, a system zachowuje wszystkie niezbędne informacje, więc nie trzeba pamiętać numeru karty ani przechowywać listy haseł jednorazowych czy tokenów. Potem w telefonie komórkowym poprzez aplikację lub stronę mobilną Bilikom wystarczy wybrać dogodne połączenie i kliknąć opcję „Kup bilet”. Po zalogowaniu się i wybraniu odpowiednich opcji (klasa, rodzaj zniżki), przechodzi się do płatności, a po jej dokonaniu bilet w postaci MMS dociera na telefon komórkowy. Podczas kontroli w pociągu należy pokazać bilet w postaci kodu 2D w telefonie albo na innym urządzeniu podłączonym do internetu.
Obecnie w systemie Bilkom dostępne są bilety na pociągi EIC oraz dawnej spółki Intercity. Do tej oferty mają zostać wkrótce dołączone bilety na inne pociągi. Bilet można kupić wszędzie, nawet do 15 minut przed odjazdem pociągu, przy pomocy telefonu działającego w dowolnej sieci. Korzystanie z systemu jest bezpłatne, a bilety kupowane w nim kosztują tyle samo co w kasach dworcowych. Bilkom zawiera też aktualne informacje na temat połączeń kolejowych, umożliwiając planowanie podróży między dowolnymi miejscami w Polsce. Ponadto oblicza czas potrzebny na dotarcie na dworzec, uwzględniając sposób poruszania się (pieszo, rowerem, samochodem). Pokazuje również aktualną pozycję wybranego pociągu, informuje o możliwych utrudnieniach na danej trasie oraz o ewentualnych opóźnieniach.
Aplikacja została udostępniona w wersjach na system iOS, Android i Windows Phone 7. Przygotowały i wdrożyły ją firmy TK Telekom i PKP Intercity.
